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A infecção por C. neoformans é designada criptococose. A maioria das infecções por C. neoformans ocorrem nos pulmões. Contudo, a meniginte fúngica, especialmente como infecção secundária em pacientes com SIDA, é frequentemente causada por C. neoformans tornando-o um fungo particularmente perigoso. As infecções causadas por este fungo são raras em pessoas com sistemas imunitários totalmente funcionais.[carece de fontes] Por esta razão, C. neoformans é por vezes descrito como um fungo oportunista.
